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Quels sont les agents pathogènes dont vous devez vous préoccuper dans votre eau ?

Il s’agit du deuxième billet d’une série de blogs sur l’assainissement de l’eau. L’objectif de cette série est de vous faire réfléchir sur votre propre système d’irrigation avant que vous ne soyez confronté à un problème. Au cours des prochaines semaines, les articles porteront sur l’identification des problèmes, l’interprétation des tests de laboratoire, le suivi des maladies dans les exploitations agricoles et les options de traitement de l’eau. Il s’agira d’une bonne ressource de mise à jour, alors assurez-vous de les mettre dans vos favoris.

Lorsqu’il s’agit de parler des problèmes liés aux maladies des cultures en serre, un point de confusion est souvent le four QUELS pathogènes peuvent être transmis par l’eau. Certains sont évidents – nous savons tous que le pythium est transmis par l’eau. Mais qu’en est-il des autres coupables, comme le Fusarium ou l’Erwinia ? Faut-il s’inquiéter de ces derniers dans l’eau de recirculation ?

En savoir plus pour savoir quand suspecter votre eau d’irrigation par rapport à d’autres facteurs lorsqu’il s’agit de maladies.

« Champignons « hydriques

Vous avez peut-être entendu le terme « à base d’eau » lorsque vous avez parlé de l’eau d’irrigation et des risques de maladie liés aux champignons, mais vous ne savez pas exactement quels agents pathogènes il inclut. Rejoignez le club.

En général, il existe deux types d’agents pathogènes que l’on peut considérer comme des champignons « hydriques ». La première – et la plus classique – est celle des agents pathogènes qui sont en fait mobiles dans l’eau (c’est-à-dire qui produisent des structures de baignade). Cela inclut le Pythium et le Phytopthora. Ces deux maladies sont techniquement classées comme des « moisissures aquatiques », étant plus étroitement liées aux algues qu’aux champignons, bien qu’elles ressemblent beaucoup à ces derniers. Elles sont bien adaptées à un environnement aquatique et peuvent vivre longtemps là où l’eau d’irrigation est stockée (citernes, étangs).

Amortissement des boutures de géraniums causées par Pythium aphanidermatum, une maladie hydrique courante.

Ensuite, il y a les pathogènes qui survivent pendant de courtes périodes dans l’eau et qui sont transportés par le flux de masse avec l’eau et les débris du sol. Nous pouvons également prendre en compte ces pathogènes d’origine hydrique, car ils peuvent théoriquement transporter des maladies d’un seul banc infecté à travers toute votre installation via votre système d’irrigation.

Fusarium, Thielaviopsis, Alternaria, Botrytis, Ascochyta, Rhizoctonia et Verticillium appartiennent tous techniquement à cette deuxième catégorie. Les espèces de Fusarium transportées dans l’eau d’irrigation ont été liées de manière concluante à des foyers de pourriture des racines. Toutefois, des liens directs entre ces autres agents pathogènes présents dans l’eau d’irrigation et les foyers de maladies doivent encore être établis dans les serres – mais nous ne devons pas les exclure. D’autres voies, telles que les éclaboussures par arrosage aérien, les bancs sales ou les couvre-sols, et la vectorisation par les outils, les mouches des champs et les moucherons fongiques, sont peut-être des sources de transmission plus probables.

Les maladies purement foliaires – comme le mildiou ou le mildiou – n’ont pas été signalées dans l’eau d’irrigation, et ce n’est pas une source de transmission connue pour ces pathogènes. Cependant, le contrôle de l’humidité dans votre serre par une ventilation adéquate est essentiel pour prévenir et contrôler ces maladies.

Bactéries dans l’eau d’irrigation

Les bactéries sont un autre type de pathogène important à prendre en compte lorsqu’il s’agit de votre eau. Plus précisément, il a été démontré qu’Erwinia (maintenant connu sous le nom de Pectobacterium carotovum), Xanthamonas et Ralstonia infectent les cultures ornementales en serre via l’eau d’irrigation. Certaines bactéries peuvent rester biologiquement actives dans l’eau pendant plus d’un mois si l’eau n’est pas traitée.

De plus, les bactéries sont susceptibles de s’accumuler et de former ce que l’on appelle un biofilm dans vos tuyaux et lignes d’irrigation. Cela peut boucher les émetteurs et créer des pertes dues au flétrissement, au stress des plantes et au surcroît de travail. Un excellent article sur le biofilm peut être trouvé ici.

Qu’en est-il des virus ?

La plupart des virus ont besoin d’une forme mécanique de transmission pour pénétrer dans la plante. Les pièces buccales perçantes des insectes vecteurs (par exemple, les thrips ou les pucerons) ou le matériel d’élagage en sont des exemples.

Mais, étonnamment, il a été démontré que certains virus se propagent dans les solutions nutritives en recirculation dans les serres, infectant les plantes via des tissus racinaires sensibles sans insecte vecteur. Citons par exemple le virus très contagieux de la rupture des fleurs de pélargonium et le virus de la flétrissure tachetée de la tomate (TSWV). Cependant, il faut des charges virales élevées pour que ces virus soient une source de transmission.

En général, la gestion des insectes vecteurs – et de vos employés – est plus importante pour contrôler la propagation des virus que la gestion de votre eau d’irrigation. Cependant, les plantes présentant des symptômes viraux doivent être éliminées le plus rapidement possible, afin d’éviter la propagation du virus par toutes les voies de transmission possibles.

Les virus des plantes (comme le virus de l’influenza aviaire, ici en échinacée) peuvent rester viables dans l’eau recyclée. Cependant, il s’agit d’une voie de transmission peu commune.

Vous trouverez plus d’informations sur les virus dans l’eau d’irrigation dans cet article scientifique : virus dans l’eau d’irrigation_2012

Quand suspecter votre eau d’irrigation est à blâmer

Comme pour toute chose, nous devons nous rappeler que corrélation ne signifie pas nécessairement causalité. Ce n’est pas parce qu’un agent pathogène se trouve dans votre approvisionnement en eau que cela signifie nécessairement que c’est de là que vient la pression de la maladie. Voici quelques questions à se poser lorsqu’un problème de maladie survient (adapté de Hong-pathogènes dans l'eau) :

Quelle partie de la plante est touchée ? S’il s’agit d’une pourriture des racines ou de la tige, l’eau d’irrigation pourrait être en cause si vous pratiquez la sous-irrigation. L’arrosage aérien ? Les taches foliaires bactériennes peuvent également être le résultat d’une eau contaminée.
Peut-on détecter un agent pathogène dans les sources d’eau ? Si le niveau de l’agent pathogène est inférieur à la limite de détection pour un test tel que l’analyse de l’ADN, il est peu probable qu’il soit à une pression suffisante pour provoquer une maladie. (Toutefois, ce n’est pas parce qu’il est présent qu’il est DÉFINITIVEMENT à l’origine de la maladie ! Plus d’informations à ce sujet dans un prochain article).
A-t-on signalé que l’agent pathogène identifié se propageait par irrigation ET qu’il était capable d’infecter la culture en question ? Si l’une de ces affirmations est vraie, il se peut que l’eau d’irrigation ne soit PAS la source de l’épidémie. L’expérience, les guides de culture et votre agent de vulgarisation local peuvent vous aider à répondre à cette question.
Examinez la distribution spatiale des plantes malades. Si seule une partie de la culture est irriguée à partir de la source d’eau suspecte, les zones irriguées à partir de différentes sources devraient présenter des différences dans le nombre et le schéma de distribution des plantes malades. Si l’eau suspecte est appliquée sur toute la zone, par exemple par l’irrigation par flux et reflux des bancs, des sols inondés ou par aspersion, attendez-vous à ce qu’une grande quantité de plantes soient touchées avec une distribution assez uniforme (plutôt que de petits foyers de plantes malades).

Maintenant que vous savez QUELS agents pathogènes peuvent se propager par l’intermédiaire de votre eau d’irrigation, l’étape suivante consiste à apprendre comment échantillonner efficacement votre eau, afin qu’elle puisse être gérée correctement dans le cadre d’un programme de gestion intégrée des maladies (GIM). Restez à l’écoute pour lire les trois parties sur les choses à faire et à ne pas faire en matière d’échantillonnage de l’eau sur le blog bientôt !

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Cet article a été rédigé par Sarah Jandricic, spécialiste de la lutte antiparasitaire intégrée en floriculture sous serre, OMAFRA et traduit par serre2jardin.com. Les produits sont sélectionnés de manière indépendante. Serre2jardin.com perçoit une rémunération lorsqu’un de nos lecteurs procède à l’achat en ligne d’un produit mis en avant.